Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YJR061WYJR061W 2808 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 RIM21YNL294C 1602 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 RPN4YDL020C 1596 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 LAS1YKR063C 1509 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 KTR6YPL053C 1341 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 SHU2YDR078C 672 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 KXD1YGL079W 657 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 YGL230CYGL230C 444 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 RPC25YKL144C 639 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 BOS1YLR078C 735 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 PCD1YLR151C 1023 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 SUI1YNL244C 327 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 RUF5-1RUF5-1 710 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 RUF5-2RUF5-2 710 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 ATG34YOL083W 1239 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 RPB8YOR224C 441 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 FOX2YKR009C 2703 nt4.84□□□□□ -1.63
VID28P40547 MSE1YOL033W 1611 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 PMS1YNL082W 2622 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 RCM1YNL022C 1473 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 TRE2YOR256C 2430 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 YCL076WYCL076W 744 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 API2YDR525W 330 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 PCL7YIL050W 858 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 YLR346CYLR346C 306 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 IRC13YOR235W 315 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 TIF4632YGL049C 2745 nt4.83□□□□□ -1.64
VID28P40547 FDC1YDR539W 1512 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 IOC4YMR044W 1428 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 MBP1YDL056W 2502 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 NUS1YDL193W 1128 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 AIM7YDR063W 450 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 CNL1YDR357C 369 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 ISC10YER180C 804 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 YFR057WYFR057W 456 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 SPO11YHL022C 1197 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 ARC15YIL062C 465 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 EFB1YAL003W 621 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 MTR2YKL186C 555 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 YBL059WYBL059W 582 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 ATG8YBL078C 354 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 WRS1YOL097C 1299 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 YOR314WYOR314W 330 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 SUL2YLR092W 2682 nt4.82□□□□□ -1.64
VID28P40547 NUR1YDL089W 1455 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 MEK1YOR351C 1494 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 SPO1YNL012W 1896 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 ENT1YDL161W 1365 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 GAT2YMR136W 1683 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 RXT3YDL076C 885 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 YFL012WYFL012W 447 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 COG7YGL005C 840 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 YGR111WYGR111W 1203 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 RFA3YJL173C 369 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 VPS25YJR102C 609 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 CSI1YMR025W 888 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 YOR131CYOR131C 657 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 YPL025CYPL025C 558 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 YFL040WYFL040W 1623 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 STP4YDL048C 1473 nt4.81□□□□□ -1.64
VID28P40547 TRM44YPL030W 1704 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 PMT4YJR143C 2289 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 EMP47YFL048C 1338 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 TRM11YOL124C 1302 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 CYM1YDR430C 2970 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 BUD25YER014C-A 462 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 YKR070WYKR070W 1059 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 YNL181WYNL181W 1224 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 YOL106WYOL106W 354 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 YOR338WYOR338W 1092 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 ATG5YPL149W 885 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 CCL1YPR025C 1182 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 VPS69YPR087W 321 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 CBP6YBR120C 489 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 ARX1YDR101C 1782 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 NAM9YNL137C 1461 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 TFA1YKL028W 1449 nt4.8□□□□□ -1.64
VID28P40547 CTK1YKL139W 1587 nt4.79□□□□□ -1.64
VID28P40547 CSM3YMR048W 954 nt4.79□□□□□ -1.64
VID28P40547 RRP7YCL031C 894 nt4.79□□□□□ -1.64
VID28P40547 MIC60YKR016W 1623 nt4.79□□□□□ -1.64
VID28P40547 CDC15YAR019C 2925 nt4.79□□□□□ -1.64
VID28P40547 YTM1YOR272W 1383 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 FRT2YAL028W 1587 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 MAL12YGR292W 1755 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 MAL32YBR299W 1755 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 PTA1YAL043C 2358 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 YKR015CYKR015C 1707 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 PEP5YMR231W 3090 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 RPL24AYGL031C 468 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 RPL24BYGR148C 468 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 RTA1YGR213C 954 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 SOL4YGR248W 768 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 AIR1YIL079C 1083 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 PSF2YJL072C 642 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 CBP3YPL215W 1008 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 Q0017Q0017 162 nt4.78□□□□□ -1.64
VID28P40547 TYW1YPL207W 2433 nt4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.1 ms