Protein–RNA interactions for Protein: P40462

TMA108, Protein TMA108, yeast

Predictions only

Length 946 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA108	P40462	SIC1	YLR079W	855 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TMA108	P40462	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TMA108	P40462	RPS19A	YOL121C	435 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TMA108	P40462	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TMA108	P40462	MGA1	YGR249W	1371 nt		4.4	□□□□□ -1.7
TMA108	P40462	PEX30	YLR324W	1572 nt		4.4	□□□□□ -1.7
TMA108	P40462	RXT3	YDL076C	885 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	API2	YDR525W	330 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	PPE1	YHR075C	1203 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	CNB1	YKL190W	528 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	USB1	YLR132C	873 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	FRT2	YAL028W	1587 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RPG1	YBR079C	2895 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RSC3	YDR303C	2658 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	HMG1	YML075C	3165 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	FAR10	YLR238W	1437 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	ACA1	YER045C	1470 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	KRE28	YDR532C	1158 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	ELF1	YKL160W	438 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YBL010C	YBL010C	843 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	IDH2	YOR136W	1110 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	SSP2	YOR242C	1116 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YPL025C	YPL025C	558 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	SUT2	YPR009W	807 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	snR19	snR19	568 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	GEM1	YAL048C	1989 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	TRM11	YOL124C	1302 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	GRC3	YLL035W	1899 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YOL075C	YOL075C	3885 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	FLO8	YER109C	2400 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	THI20	YOL055C	1656 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RDI1	YDL135C	609 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	THI13	YDL244W	1023 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RNH202	YDR279W	1053 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	BCP1	YDR361C	852 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	COX18	YGR062C	951 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	THI11	YJR156C	1023 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	MTH1	YDR277C	1302 nt		4.38	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	LAS1	YKR063C	1509 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	TPD3	YAL016W	1908 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RRG1	YDR065W	1098 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	LSM12	YHR121W	564 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YIL171W	YIL171W	330 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	BAT2	YJR148W	1131 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	IRC25	YLR021W	540 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	ECM8	YBR076W	1065 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	TED1	YIL039W	1422 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	CIT1	YNR001C	1440 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	APC1	YNL172W	5247 nt		4.37	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	GRX3	YDR098C	858 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	TFB3	YDR460W	966 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RPL24A	YGL031C	468 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	EFB1	YAL003W	621 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	GMH1	YKR030W	822 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YLR042C	YLR042C	486 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	SUI1	YNL244C	327 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	SIL1	YOL031C	1266 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YOR114W	YOR114W	885 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	HSH49	YOR319W	642 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YBR096W	YBR096W	693 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	XKS1	YGR194C	1803 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RRP14	YKL082C	1305 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	SER3	YER081W	1410 nt		4.36	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	SSO2	YMR183C	888 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	EAF7	YNL136W	1278 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YOR263C	YOR263C	408 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	PBN1	YCL052C	1251 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	PSY4	YBL046W	1326 nt		4.35	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YBR238C	YBR238C	2196 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	UBP12	YJL197W	3765 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	DPB4	YDR121W	591 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	BUD25	YER014C-A	462 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	ISC10	YER180C	804 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	YGL088W	YGL088W	366 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RPL8A	YHL033C	771 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RPL18B	YNL301C	561 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	RPL18A	YOL120C	561 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	DSN1	YIR010W	1731 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.34	□□□□□ -1.71
TMA108	P40462	EPO1	YMR124W	2832 nt		4.34	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	MDR1	YGR100W	2853 nt		4.34	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	MTR10	YOR160W	2919 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	SPC105	YGL093W	2754 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	RPS18A	YDR450W	441 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	TYS1	YGR185C	1185 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	YHR112C	YHR112C	1137 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	SEC72	YLR292C	582 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	COS1	YNL336W	1146 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	OXR1	YPL196W	822 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	USV1	YPL230W	1176 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	DSL1	YNL258C	2265 nt		4.33	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	MSK1	YNL073W	1731 nt		4.32	□□□□□ -1.72
TMA108	P40462	GCD1	YOR260W	1737 nt		4.32	□□□□□ -1.72

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