Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PBX1P40424 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PBX1P40424 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PBX1P40424 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PBX1P40424 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PBX1P40424 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBX1P40424 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBX1P40424 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBX1P40424 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBX1P40424 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PBX1P40424 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBX1P40424 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBX1P40424 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBX1P40424 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBX1P40424 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBX1P40424 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBX1P40424 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBX1P40424 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBX1P40424 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBX1P40424 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBX1P40424 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBX1P40424 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBX1P40424 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBX1P40424 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBX1P40424 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PBX1P40424 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PBX1P40424 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms