Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGCXP38435 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGCXP38435 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGCXP38435 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGCXP38435 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGCXP38435 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGCXP38435 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGCXP38435 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGCXP38435 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGCXP38435 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGCXP38435 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGCXP38435 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GGCXP38435 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGCXP38435 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGCXP38435 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGCXP38435 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms