Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBRP36941 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBRP36941 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBRP36941 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBRP36941 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBRP36941 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBRP36941 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBRP36941 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBRP36941 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBRP36941 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBRP36941 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBRP36941 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBRP36941 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBRP36941 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBRP36941 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBRP36941 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBRP36941 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBRP36941 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBRP36941 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBRP36941 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBRP36941 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBRP36941 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBRP36941 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBRP36941 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBRP36941 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBRP36941 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBRP36941 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBRP36941 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBRP36941 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBRP36941 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBRP36941 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBRP36941 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBRP36941 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBRP36941 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBRP36941 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBRP36941 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms