Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms