Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
L1CAMP32004 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms