Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFNP31947 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFNP31947 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFNP31947 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFNP31947 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFNP31947 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SFNP31947 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFNP31947 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFNP31947 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SFNP31947 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFNP31947 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFNP31947 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFNP31947 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFNP31947 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFNP31947 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFNP31947 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFNP31947 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SFNP31947 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFNP31947 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFNP31947 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFNP31947 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFNP31947 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFNP31947 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFNP31947 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFNP31947 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFNP31947 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFNP31947 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFNP31947 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFNP31947 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFNP31947 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFNP31947 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFNP31947 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFNP31947 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFNP31947 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFNP31947 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFNP31947 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFNP31947 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SFNP31947 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFNP31947 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFNP31947 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFNP31947 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFNP31947 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFNP31947 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SFNP31947 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms