Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2BP30876 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2BP30876 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms