Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPP30301 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPP30301 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPP30301 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPP30301 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPP30301 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPP30301 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPP30301 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms