Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALDH4A1P30038 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH4A1P30038 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms