Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRMP28827 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRMP28827 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
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