Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4AP27815 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms