Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF4P23510 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF4P23510 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms