Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGS1P23219 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGS1P23219 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms