Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VDAC1P21796 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VDAC1P21796 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms