Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD247P20963 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD247P20963 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD247P20963 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD247P20963 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD247P20963 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD247P20963 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD247P20963 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD247P20963 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms