Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1D1P20393 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D1P20393 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms