Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL2P19875 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL2P19875 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms