Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCP1P17987 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCP1P17987 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCP1P17987 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCP1P17987 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCP1P17987 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCP1P17987 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCP1P17987 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCP1P17987 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCP1P17987 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCP1P17987 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCP1P17987 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCP1P17987 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCP1P17987 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCP1P17987 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCP1P17987 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCP1P17987 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCP1P17987 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms