Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB9P17482 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms