Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPCAMP16422 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPCAMP16422 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms