Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms