Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB1P16220 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB1P16220 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB1P16220 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB1P16220 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB1P16220 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB1P16220 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB1P16220 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB1P16220 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB1P16220 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB1P16220 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB1P16220 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB1P16220 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB1P16220 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CREB1P16220 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CREB1P16220 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CREB1P16220 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms