Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPA2P15927 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPA2P15927 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPA2P15927 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA2P15927 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA2P15927 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms