Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A3P13637 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms