Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARGP13631 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARGP13631 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARGP13631 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARGP13631 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARGP13631 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARGP13631 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARGP13631 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARGP13631 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARGP13631 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARGP13631 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARGP13631 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARGP13631 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARGP13631 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms