Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HARSP12081 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HARSP12081 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HARSP12081 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HARSP12081 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HARSP12081 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HARSP12081 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HARSP12081 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HARSP12081 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HARSP12081 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HARSP12081 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HARSP12081 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HARSP12081 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HARSP12081 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HARSP12081 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HARSP12081 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HARSP12081 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms