Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PYGBP11216 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PYGBP11216 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PYGBP11216 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PYGBP11216 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PYGBP11216 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PYGBP11216 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PYGBP11216 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PYGBP11216 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PYGBP11216 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PYGBP11216 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PYGBP11216 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms