Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HKR1P10072 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HKR1P10072 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HKR1P10072 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HKR1P10072 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HKR1P10072 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HKR1P10072 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HKR1P10072 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HKR1P10072 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HKR1P10072 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HKR1P10072 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HKR1P10072 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms