Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI3P10071 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI3P10071 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI3P10071 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLI3P10071 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLI3P10071 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI3P10071 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI3P10071 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI3P10071 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLI3P10071 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLI3P10071 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLI3P10071 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLI3P10071 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLI3P10071 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI3P10071 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI3P10071 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLI3P10071 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI3P10071 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI3P10071 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI3P10071 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI3P10071 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI3P10071 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLI3P10071 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLI3P10071 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLI3P10071 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLI3P10071 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI3P10071 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI3P10071 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI3P10071 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI3P10071 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLI3P10071 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GLI3P10071 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLI3P10071 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLI3P10071 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms