Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV1-13P0DP09 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV1-13P0DP09 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms