Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGB3P0DN86 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms