Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIMD1P0DJR0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIMD1P0DJR0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms