Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAA2P0DJI9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms