Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L1P0CL83 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STAG3L1P0CL83 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STAG3L1P0CL83 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms