Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFB1P0C5Y9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2AFB1P0C5Y9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms