Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CT47B1P0C2W7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms