Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC175P0C221 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms