Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms