Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC4P09017 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms