Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT7P08729 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT7P08729 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT7P08729 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT7P08729 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT7P08729 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT7P08729 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms