Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP3A4P08684 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms