Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms