Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSLP07711 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSLP07711 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSLP07711 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTSLP07711 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTSLP07711 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSLP07711 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSLP07711 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSLP07711 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSLP07711 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSLP07711 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSLP07711 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSLP07711 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSLP07711 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSLP07711 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSLP07711 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms