Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFMP07197 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFMP07197 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFMP07197 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFMP07197 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFMP07197 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFMP07197 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFMP07197 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFMP07197 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFMP07197 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFMP07197 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFMP07197 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFMP07197 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFMP07197 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFMP07197 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFMP07197 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEFMP07197 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEFMP07197 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFMP07197 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEFMP07197 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFMP07197 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFMP07197 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFMP07197 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFMP07197 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFMP07197 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFMP07197 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFMP07197 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFMP07197 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFMP07197 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFMP07197 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFMP07197 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFMP07197 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFMP07197 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFMP07197 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFMP07197 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFMP07197 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFMP07197 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFMP07197 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEFMP07197 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEFMP07197 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms