Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB1P05556 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB1P05556 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB1P05556 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms