Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms