Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC1P02654 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC1P02654 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC1P02654 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC1P02654 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC1P02654 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC1P02654 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC1P02654 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC1P02654 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOC1P02654 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOC1P02654 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOC1P02654 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOC1P02654 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC1P02654 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOC1P02654 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms