Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL2A1P02458 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL2A1P02458 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms